Mendeley é um gerenciador de referências bibliográficas gratuito capaz de extrair os metadados de PDFs automaticamente, sincronizar as referências do desktop com uma interface web (acessível de qualquer lugar) e tem um toque de web social. Apesar de estar no início de seu desenvolvimento diversas funcionalidades já estão disponíveis e “usáveis”. Para um resumo ilustrado consulte o How it works.

Uma das propostas do projeto é criar um Last.fm da pesquisa científica. O Last.fm coleta os hábitos musicais de seus usuários registrando que músicas/bandas você e outros milhões de usuários estão ouvindo. Com esse grande banco de dados o site criou um sistema de recomendações de artistas/músicas/usuários que permite você descobrir músicos diferentes e diversificar seu gosto musical, através de suas próprias preferências. Outro sistema bem conhecido de recomendações baseado nos hábitos do usuário  é o da Amazon. O Mendeley, portanto, coletaria seus hábitos acadêmicos (que artigos você lê/têm/gosta) podendo gerar inúmeras estatísticas, recomendar outros pesquisadores “similares” e artigos relevantes para sua pesquisa. A diferença é que, nas palavras de Victor Henning (fundador):

O Last.fm deixa qualquer um ver as músicas que você escuta enquanto o Mendeley mantém seus dados numa conta privada que não pode ser acessada por mais ninguém.¹

Um detalhe importante é que o objetivo primário do Mendeley não é ser uma ferramenta social para cientistas, mas sim conectar os produtos da pesquisa científica (i.e. artigos); as redes de pessoas surgem de forma secundária, ao redor destes agregados semânticas de artigos científicos. Com os hábitos acadêmicos em mãos torna-se simples identificar as revistas, artigos e autores mais lidos, mostrando em tempo real o alcance de uma publicação e uma estimativa (ainda que restrita) da popularidade de um artigo. As possibilidades são, no mínimo, interessantes.

Impressões sobre a versão 0.9.0 0.9.1 no Ubuntu 8.10.

Acompanho o desenvolvimento do Mendeley desde fevereiro e com o lançamento da versão 0.9.0 resolvi escrever algumas notas. Saiu a versão 0.9.1 antes de eu terminar de escrever!

Visualizador de PDFs embutido

Primeira novidade que testei, pois queria ver se ele funcionava direitinho no Linux². Para minha surpresa o leitor funcionou relativamente bem, inclusive grifar e fazer anotações bonitinhas como na propaganda. Um incoveniente é que ao navegar pelo documento o conteúdo demora milissegundos (as vezes mais) para renderizar (entrar no foco). Não sei se isso ocorre em outros sistemas operacionais, mas parece que sim.

Anotando no visualizador de PDFs integrado

Como mostra a imagem acima, as anotações nos PDFs serão incluídas e sincronizáveis para a interface web na próxima versão do Mendeley Desktop³. Pra mim isso vai ser interessante já que minhas notas ficam perdidas distribuidas por todo lugar (e não apontam para o ponto exato no que a que se referem). O buscador do leitor de PDF escurece o fundo realçando os termos procurados, preciso usar mais pra saber o que prefiro… de qualquer modo ele não retorna ao início do documento quando chega no último termo; deveria.

Buscador de texto

Detecção de documentos duplicados

Estava realmente esperando esta função, pois se importasse 2 vezes um mesmo arquivo nas versões anteriores eu ficava com todas as referências duplicadas. A detecção funcionou bem para referências idênticas, mas ainda obtive uma série de entradas duplicadas. Aparentemente, se importo uma referência que já está presente no meu banco de dados (criada através da extração dos metadados do PDF) e existe alguma(s) diferença(s) entre os metadados as duas entradas são mantidas. Ainda não é possível fundir entradas (manualmente ou automaticamente)⁴. Ao importar uma referência cujo o PDF já existe, o programa também não cria o link automaticamente para o arquivo. A solução seria estaria na habilidade de fundir referências, possivelmente de forma assistida, já que o programa não tem como saber qual campo está a informação errada⁵.

Coleções

Agora é possível criar coleções de artigos, ferramenta básica e útil de qualquer gerenciador. Você tem a opção de carregar os PDFs da coleção para a interface web e torná-la pública. Legal para compartilhar listas de referências com outros internautas (dá até para colar em outras páginas); criei veja um exemplo aqui. Se quiser compartilhar uma lista de referências com seus co-autores do próximo artigo a opção shared collection permite definir até 9 contribuidores para a lista (será interessante quando as anotações dos PDFs forem sincronizadas junto).

Shared collections no Mendeley

Extração de metadados dos PDFs

Uma das principais funções do Mendeley ainda precisa melhorar. No meu caso, diversos artigos aparecem com os dados trocados e/ou faltando, e muitas vezes coisas que talvez você nunca perceba como colocar a página inicial do artigo como o volume da revista. Talvez quem precise melhorar também sejam as editoras na hora de colocar os metadados no pdf… Isso me lembra uma discussão no FriendFeed sobre os problemas de usarmos PDFs e não coisas melhores e mais semânticas para se comunicar em ciência. Quem sabe retomo esta discussão outra hora.

Outras observações

O bookmarklet que importa as referências automaticamente das páginas na web não consegue importar referências da Nature, por exemplo (não consegui, pelo menos). Neste aspecto o importador do Zotero é o mais prático e completo.

Deveria reconhecer automaticamente as abreviações das revistas para que não apareça Dev. Biol., Dev Biol e Developmental Biology como periódicos diferentes após importar os dados.

A barrinha de sugestões did you mean? é bem simpática, mas não deu sugestões muito acuradas, por enquanto

O Mendeley Desktop poderia manter um arquivo oculto no formato bib com o banco de referências atualizado. Isso facilitaria muito para quem usa LaTeX, pois não precisaria ficar exportando arquivos bib cada vez que quero atualizar uma lista de referências de um trabalho. Só adicionar a referência e compilar o LaTeX.

Por fim, acho que o que eu realmente gostaria de ver funcionando é o sistema de recomendações de artigos e usuários com interesses em comum. A sincronização do desktop não está funcionando, pois eles estão turbinando os servidores (sync web para desktop funciona) [Sync está funcionando novamente]. Se quiser acompanhar todas as notas de atualizações do Mendeley entre aqui.

Fontes

• network.nature.com/people/mfenner/blog/2008/09/05/interview-with-victor-henning-from-mendeley
• www.mendeley.com/blog/2009/04/one-million-articles-uploaded-to-mendeley/
• uk.techcrunch.com/2009/05/12/mendeleys-klingon-battle-cruiser-de-cloaks-in-london-with-the-lastfm-for-academia/
• www.mendeley.com/blog/2009/05/ologeez-founder-joins-mendeley/